[TimeBandit]

Acho que eu peguei a versão contada pelo propagando do universo, nela o imperador foi desenvolvendo essa habilidade ao decorrer dos séculos por mérito próprio. Ou eu posso simplesmente ter entendido errado essa parte.

Tem um lore antigo e um atualizado.

No antigo o imperador nasceu do sacrifício coletivo de milhares de psykers, acho que na época eles usavam a palava xamã pra descreverem as pessoas com acesso ao warp.

Eles fizeram isso porque havia uma entidade no além que estava comendo a alma dos xamãs e impedindo-os de reencanarem.
Então eles resolveram cometer um suicídio coletivo. Todos ao mesmo tempo. Assim suas almas foram pro além, essa entidade não foi capaz de consumir todas e eles reencarnaram em um único corpo imortal. Que no futuro veio a se tornar o imperador da humanidade.

Mas como falei, isso é um lore antigo. Acho que foi descartado para dar uma origem mais misteriosa ao imperador no lore mais recente.

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E também deveria haver conflitos demais com as histórias mais recentes.